Název "záhněda" pochází z českého slova "zahnědlý", což odkazuje na charakteristickou hnědou až kouřově šedou barvu tohoto minerálu. V mezinárodním kontextu je tento kámen známý jako "smoky quartz" (kouřový křemen) v angličtině, "Rauchquarz" v němčině nebo "quartz fumé" ve francouzštině - všechny tyto názvy poukazují na jeho typickou kouřovou barvu.
Záhněda patří mezi nejstarší známé minerály používané člověkem. Archeologické nálezy dokazují, že byla využívána již v paleolitu (starší době kamenné) pro výrobu nástrojů a zbraní. Díky své tvrdosti a odolnosti byla záhněda, stejně jako jiné druhy křemene, ideálním materiálem pro výrobu ostrých hrotů a čepelí.
Ve starověkých civilizacích byla záhněda často spojována s podsvětím a duchovním světem. Keltové věřili, že záhněda má schopnost komunikovat s duchy a používali ji při rituálech spojených s uctíváním předků. V římské kultuře byla záhněda spojována s bohem Plutem, vládcem podsvětí, a byla používána jako ochranný talisman.
Ve středověku byla záhněda považována za mocný ochranný kámen proti negativním energiím a černé magii. Alchymisté ji používali při svých experimentech a věřili, že dokáže absorbovat negativní energie. V této době byla také spojována se Saturnem a jeho vlivem na zemské energie.
V 18. a 19. století se záhněda stala oblíbeným materiálem pro výrobu šperků, zejména v období romantismu, kdy její temná, tajemná barva dokonale odpovídala estetice tohoto uměleckého směru. Viktoriánská éra přinesla další vlnu popularity záhnědy, kdy byla často používána ve smutečních špercích.
V moderní době zažívá záhněda renesanci zájmu, zejména v oblasti alternativní medicíny a krystaloterapie. Je ceněna nejen pro svou estetickou hodnotu, ale i pro údajné léčivé a ochranné vlastnosti, které jí byly připisovány po tisíce let.